#/bin/sh
ls -al
といったように書いたテキストファイルを用意して、実行権を与えます。これで、通常のコマンドのようにこのファイルを動かすだけです。
C言語でプログラムの中から他のプログラムを実行したい場合は、systemを使います。
system "実行したいコマンド";
でできます。実行したいコマンドは文字列ですので、文字列変数でもいいです。例えば、
char str[256];
strcpy(str, "ls -al");
system str;
といった使い方もできます。