そういう場合は、リンクを使います。リンクは実体の無いコピーみたいなものです。Windows95のショートカット、Macのエイリアス(UNIXのエイリアスとはまったく別。間違えないように。)と同じようなものです。リンクは"ln"コマンドを使います。
"ln -s リンクしたいファイルorディレクトリ リンクしたい場所"とします。
例えば、共用のデータディレクトリをよく使いたいとします。しかし、これを自分のところにコピーしていたらディスクスペースがもったいないですし、誰かが最新のデータを入れたらコピーし直さなくてはいけません。毎回移動するのも面倒とします。こういう場合は自分のところにリンクします。